La coopération transfrontalière entre la France et l’Allemagne révèle un changement fondamental de ses structures institutionnelles et de son fonctionnement administratif et politique. Les coopérations partielles et sectorielles, jusqu’alors souvent ponctuelles, de même que la prédominance des exécutifs administratifs à tous les échelons de coopération ont conduit à l’émergence de coopérations à niveaux multiples et à la constitution d’instances politico-administratives sur lesquelles ont peut porter un regard nuancé. Le succès de ces nouveaux systèmes transnationaux en devenir dépendra de la répartition des tâches non seulement entre échelons, mais également entre institutions et entres instances politiques et administratives, dans la perspective de l’instauration d’une gouvernance territoriale transfrontalière.